R

R es un lenguaje y ambiente de programación para análisis estadístico y gráfico. Se trata de un software libre, resultado de la implementación GNU del premiado lenguaje S. R y S-Plus -versión comercial de S- son, probablemente, los dos lenguajes más utilizados en investigación por la comunidad estadística, siendo además muy populares en el campo de la investigación biomédica y en la bioinformática.

Ejemplo de todo esto es Bioconductor (http://www.bioconductor.org), un proyecto de software libre enfocado al análisis y la comprensión de datos genómicos, que ha sido desarrollado sobre R. Bioconductor ofrece, por ej., paquetes específicos para la normalización, análisis, y anotación de microarrays. Algunas aplicaciones conocidas que usan R y/o Bioconductor en este contexto son SNOMAD y R/MAANOVA.

Imagen: graph and Rgraphviz: Graph of interacting protein pairs with proteins (nodes) colored according to cell cycle expression profile cluster membership. Created with graph and plotted using Rgraphviz.

R se distribuye bajo la licencia GNU GPL y está disponible para los sistemas operativos Windows, Macintosh, Unix y Linux.

Versiónes de descarga: Windows, Linux, MAC OS X.

Para saber más sobre bioconductor.